Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms