Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMX1Q04741 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms