Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms