Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms