Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms