Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms