Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDR2Q01850 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms