Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms