Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms