Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms