Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYBPC1Q00872 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms