Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms