Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms