Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKOR1P84550 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms