Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIM1P81133 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIM1P81133 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIM1P81133 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms