Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HBBP68871 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HBBP68871 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HBBP68871 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms