Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms