Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms