Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms