Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRATP43155 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRATP43155 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRATP43155 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms