Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC1P35052 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPC1P35052 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms