Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms