Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms