Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDC1P18827 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDC1P18827 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDC1P18827 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDC1P18827 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDC1P18827 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDC1P18827 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms