Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NME1P15531 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms