Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL2P13500 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL2P13500 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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