Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYH1P12882 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms