Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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