Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms