Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms