Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PPFIA3O75145 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms