Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms