Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms