Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A8MVJ9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A8MVJ9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A8MVJ9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A8MVJ9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A8MVJ9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms