Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms