Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBNO2Q9Y2G9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms