Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHANK2Q9UPX8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms