Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC12A4Q9UP95 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms