Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms