Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms