Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCMF1Q9P0J7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms