Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms