Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms