Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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