Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZYG11BQ9C0D3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms