Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms