Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms