Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms