Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms