Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms